中心自组建以来，制定了中心章程，建立健全了相关规章制度，打破以往学科专业领域或组织机构边界的限制，采用“领军人物+优秀团队”模式的协同运作机制，采用利益驱动、优势互补的动力机制，建立了对协同创新中心成员目标管理的多元考核评价体系，实行原创性技术成果在协同创新中心内优先、优惠转让制，构建学科资源共享制。

　　初步形成了多元、开放、动态、紧密的组织运行机制，建立了协同创新中心平台、资源、仪器设备共享信息系统，建立了协同创新中心办公管理系统，初步探索形成了一个高等院校、科研院所、行业骨干企业协同创新主动服务国家战略的新模式。